電熱恒溫水浴鍋在加熱時適合使用去離子水（DI水），也就是通過去離子過程處理的水，去除了大部分的礦物質和雜質。去離子水不容易在加熱過程中產生沉淀或腐蝕性的物質，這樣可以更好地保護實驗器材，尤其是對于那些對水質要求較高的實驗。

當然，在一些簡單的實驗中，電熱恒溫水浴鍋使用純凈的自來水也是可以的，但長期使用或對實驗結果要求較高的場合，建議使用去離子水。在實驗中，確保水質的純凈度對于保證實驗結果的準確性和重復性是非常重要的。如果是在進行生命科學或化學領域的實驗，通常都會推薦使用去離子水或更高純度的實驗室用水。